Лабораторија за хемоинформатику
Научноистраживачка делатност Лабораторије за хемоинформатику заснива се на испитивању реакционих механизама хемијских реакција са посебним освртом на механизме антиоксидативне активности једињења, затим на испитивању инхибиторске активности једињења у циљу одређивања антиканцерогених, микробиолошких и осталих биохемијских активности једињења, као и на утврђивању односа структуре и биохемијске активности испитиваних једињења у циљу објашњења активности појединих молекула и предвиђања могућих биохемијских активности молекула. Такође, лабораторија се бави развојем нових молекулских дескриптора и статистичких модела за процену молекулске сличности.
Мисија Лабораторије за хемоинформатику је да кроз научноистраживачки рад и едукацију, уз перманентно усавршавање истраживача, унапређење постојећих и увођење нових методолошких приступа истраживања, допринесе развоју постојећих и утврђивању нових сазнања у области механизама хемијских реакција и зависности реактивности молекула од њихове хемијске структуре.
Визија Лабораторије за хемоинформатику је да, заједно са другим лабораторијама, одељењима за истраживање и истраживачким групама које функционишу у оквиру Државног универзитета у Новом Пазару, прерасте у Центар изврсности, затим да успостави и развија међународну научну сарадњу и допринесе интеграцији Државног универзитета у Новом Пазару у европски научноистраживачки простор.
Научноистраживачки тим
Придружени чланови
- Наима Црнишанин
ИСТРАЖИВАЧКИ РЕСУРСИ
Истраживачка опрема
- Сервер са 11 централних процесорских јединица
- Лиценцирани програм Gaussian 09
- Лиценцирани програм GaussView
- Open-source софтвери: AutoDock4, AGFR, BIOVIA Discovery Studio Visualizer...
- Више десктоп рачунара са по 4 процесорске јединице
Пројекти у оквиру којих се реализују истраживања
- Пројекат Министарства за науку, технолошки развој и иновације (МНТРИ) бр. 451-03-65/2024-03/200252
- Билатерални пројекат Србија–Словенија 2023–2025, бр. 337-00-110/2023-05/3: „Elucidation of antioxidative and inhibitory activities of tannins using combined experimental and computational approach"
- Билатерални пројекат Србија–Словачка 2024–2025, бр. 337-00-3/2024-05/10: „Derivatives of phenolic compounds: experimental and theoretical investigation of their antioxidant effect and oxidation pathways"
- Билатерални пројекат Србија–Аустрија 2024–2026, бр. 337-00-216/2023-05/259: „Preventing LPMO from self-destruction by oxidative damage"
- DAAD Project: Cooperative international Master study program Applied Chemistry – GeSeMAC (MSc)
Сарадња са другим научноистраживачким институцијама
- Природно-математички факултет Универзитета у Крагујевцу
- Институт за информационе технологије Универзитета у Крагујевцу
- Факултет агробиотехничких наука у Осијеку, Хрватска
- Институт Руђер Бошковић у Загребу, Хрватска
- Институт за науку о храни и исхрани, Факултет за хемијску и прехрамбену технологију, Братислава, Словачка
- Универзитет примењених наука у Мерсебургу, Немачка
- Универзитет у Хаилу, Саудијска Арабија
- Природно-математички факултет Универзитета у Марибору
- Факултет за хемију и хемијску технологију Универзитета у Марибору
- Департман за математику, Нормални универзитет у Шинингу, Кина
- Департман за математику, Шахид Мадани универзитет, Табриз, Иран
Постигнути резултати
Докторске дисертације и мастер радови:
- Џенета Нумановић (2019). „Испитивање механизама антиоксидативног деловања ескулетина"
- Марко Антонијевић (2019). „Испитивање механизама антиоксидативног деловања 7-хидроксикумарина"
- Џенана Феризовић (2019). „Теоријска компаративна студија антирадикалске активности 1,2,5-трихидроксиантрахинона и 1,2,5-трихидрокситиоксантона"
- Едита Ћосовић (2023). „2-Хидрокси-1,4-нафтохинон као потенцијални антиоксидант у поларном и неполарном окружењу"
- Зарфија Демировић (2023). „Теоријски приступ испитивању антиоксидативног капацитета 5-хидрокси-1,4-нафтохинона"
- Семра Адиловић (2023). „Испитивање антиоксидативне активности 2-хидрокси-1,4-бензохинона"
- Ајлана Гухдија (2024). „Теоријска студија антиоксидативне активности адреналина"
- Зилха Малмудировић (2024). „6-Хидрокси-нафтохинон као потенцијални антиоксидант – студија применом теорије функционала густине"
- Емина Кујовић (2024). „Антрахинони: налажење у природи, синтеза, биолошка и хемијска активност, и примена"
- Ханиса Хасановић (2024). „Испитивање антиоксидативног капацитета допамина применом теорије функционала густине"
Научни радови и саопштења на научним скуповима
Рад Лабораторије за хемоинформатику допринео је публиковању великог броја резултата у међународним часописима високе цитираности, затим у часописима од националног значаја, као и представљању резултата на међународним и националним научним скуповима. У наставку су дати неки од одабраних резултата рада Лабораторије публиковани у претходне три године (за комплетан увид у радове публиковане од стране чланова Лабораторије користити линкове који стоје уз имена истраживача Лабораторије):
- Simijonović D, Avdović E, Milić SJ, Antonijević M, Milenković D, Marković K, Grujović M, Stojković DL, Dekić M, Marković Z. Investigation of Antimicrobial and Anti-Inflammatory Efficacy of Newly Synthesized Pyrogallol-Coumarin Hybrids: In Vitro and In Silico Studies. Pharmaceutics. 2024;16(11):1472. DOI
- Jevtić M, Pirković MS, Komazec T, Mojić M, Mijatović S, Maksimović-Ivanić D, Dimić D, Marković Z, Simijonović D, Milenković D, Avdović E. A Comprehensive Evaluation of a Coumarin Derivative and Its Corresponding Palladium Complex as Potential Therapeutic Agents in the Treatment of Gynecological Cancers. Pharmaceutics. 2024;16(11):1437. DOI
- Milanović Ž, Marković Z, Kesić A, Jovanović Stević S, Petrović B, Avdović E. Influence of acid–base equilibrium on interactions of some monofunctional coumarin Pd(II) complexes with biologically relevant nucleophiles. Dalton Transactions. 2024;53(19):8275–8288. DOI
- Milanović Ž, Dimić D, Avdović EH, Simijonović DM, Nakarada Đ, Jakovljević V, Vojinović R, Marković ZS. Mechanism of Antiradical Activity of Coumarin-Trihydroxybenzohydrazide Derivatives: A Comprehensive Kinetic DFT Study. Antioxidants. 2024;13(2):143. DOI
- Gutman I, Furtula B, Redžepović I. On Topological Indices and Their Reciprocals. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;91:287–297. Линк
- Gutman I, Redžepović I, Pantović S. Note on Some New (n, m)-Type Bounds for Graph Energy. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;91(3):797–803. Линк
- Redžepović I, Soldatović TV. Comparative Cheminformatics Study on Structural and Physiological Similarity of Bridged Heterometallic Complexes. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;92(2):317–336. Линк
- Akbar A, Gutman I, Furtula B, Redžepović I, Došlić T, Zahid R. Extremal Results and Bounds for Atom-Bond Sum-Connectivity Index. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;92(2):271–314. Линк
- Akbar A, Gutman I, Redžepović I, Mazorodze JP, Albalahi AM, Amjad HE. On the Difference of Atom-Bond Sum-Connectivity and Atom-Bond-Connectivity Indices. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;91(3):725–740. Линк
- Antonijević M, Avdović E, Simijonović D, Milanović Ž, Žižić M, Marković Z. Investigation of novel radical scavenging mechanisms in the alkaline environment: Green, sustainable and environmentally friendly antioxidative agent(s). Science of The Total Environment. 2024;912:169307. DOI
- Akbar A, Gutman I, Redžepović I, Albalahi AM, Raza Z, Hamza AE. Symmetric Division Deg Index: Extremal Results and Bounds. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2023;90(2):269–299. Линк
- Marković Z, Komolkin AV, Egorov AV, Milenković D, Jeremić S. Alizarin as a potential protector of proteins against damage caused by hydroperoxyl radical. Chemico-Biological Interactions. 2023;373:110395. DOI
- Simijonović DM, Milenković DA, Avdović EH, Milanović ŽB, Antonijević MR, Amić AD, Dolićanin Z, Marković ZS. Coumarin N-Acylhydrazone Derivatives: Green Synthesis and Antioxidant Potential—Experimental and Theoretical Study. Antioxidants. 2023;12(10):1858. DOI
- Milanović Ž, Antonijević M, Avdović E, Simić V, Milošević M, Dolićanin Z, Kojić M, Marković Z. In silico evaluation of pharmacokinetic parameters, delivery, distribution and anticoagulative effects of new 4,7-dihydroxycoumarin derivative. J. Biomol. Struct. Dyn. 2023;42(16):8343–8358. DOI
- Milanović Ž, Dimić D, Klein E, Biela M, Lukeš V, Žižić M, Avdović E, Bešlo D, Vojinović R, Dimitrić Marković J, Marković Z. Degradation Mechanisms of 4,7-Dihydroxycoumarin Derivatives in Advanced Oxidation Processes: Experimental and Kinetic DFT Study. Int. J. Environ. Res. Public Health. 2023;20(3):2046. DOI
Монографије
Рад Лабораторије за хемоинформатику резултирао је и објављивањем следећих монографија, тј. поглавља у монографским студијама:
- Светлана Марковић, Зоран Марковић. Молекулско моделирање. Центар за научно истраживачки рад САНУ и Универзитета у Крагујевцу, 2012. ISBN 978-86-81037-32-4
- Jeremić S, Marković Z. Free Radical Scavenger Activity and P-glycoprotein Inhibition Capacity of 1,2,4-Trihydroxyxanthone. In: Filipovic N, editor. Computational Bioengineering and Bioinformatics. ICCB 2019. Learning and Analytics in Intelligent Systems, vol 11. Springer, Cham, 2020. DOI