Laboratorija za hemoinformatiku

Naučnoistraživačka delatnost Laboratorije za hemoinformatiku zasniva se na ispitivanju reakcionih mehanizama hemijskih reakcija sa posebnim osvrtom na mehanizme antioksidativne aktivnosti jedinjenja, zatim na ispitivanju inhibitorske aktivnosti jedinjenja u cilju određivanja antikancerogenih, mikrobioloških i ostalih biohemijskih aktivnosti jedinjenja, kao i na utvrđivanju odnosa strukture i biohemijske aktivnosti ispitivanih jedinjenja u cilju objašnjenja aktivnosti pojedinih molekula i predviđanja mogućih biohemijskih aktivnosti molekula. Takođe, laboratorija se bavi razvojem novih molekulskih deskriptora i statističkih modela za procenu molekulske sličnosti.

Misija Laboratorije za hemoinformatiku je da kroz naučnoistraživački rad i edukaciju, uz permanentno usavršavanje istraživača, unapređenje postojećih i uvođenje novih metodoloških pristupa istraživanja, doprinese razvoju postojećih i utvrđivanju novih saznanja u oblasti mehanizama hemijskih reakcija i zavisnosti reaktivnosti molekula od njihove hemijske strukture.

Vizija Laboratorije za hemoinformatiku je da, zajedno sa drugim laboratorijama, odeljenjima za istraživanje i istraživačkim grupama koje funkcionišu u okviru Državnog univerziteta u Novom Pazaru, preraste u Centar izvrsnosti, zatim da uspostavi i razvija međunarodnu naučnu saradnju i doprinese integraciji Državnog univerziteta u Novom Pazaru u evropski naučnoistraživački prostor.

Laboratorija za hemoinformatiku 1
Laboratorija za hemoinformatiku 2
Laboratorija za hemoinformatiku 3

Naučnoistraživački tim

Doc. dr Svetlana Jeremić
Doc. dr Svetlana Jeremić
glavni istraživač
Prof. dr Zoran Marković
Prof. dr Zoran Marković
Doc. dr Izudin Redžepović
Doc. dr Izudin Redžepović

Pridruženi članovi

ISTRAŽIVAČKI RESURSI

Istraživačka oprema

  • Server sa 11 centralnih procesorskih jedinica
  • Licencirani program Gaussian 09
  • Licencirani program GaussView
  • Open-source softveri: AutoDock4, AGFR, BIOVIA Discovery Studio Visualizer...
  • Više desktop računara sa po 4 procesorske jedinice

Projekti u okviru kojih se realizuju istraživanja

  • Projekat Ministarstva za nauku, tehnološki razvoj i inovacije (MNTRI) br. 451-03-65/2024-03/200252
  • Bilateralni projekat Srbija–Slovenija 2023–2025, br. 337-00-110/2023-05/3: „Elucidation of antioxidative and inhibitory activities of tannins using combined experimental and computational approach"
  • Bilateralni projekat Srbija–Slovačka 2024–2025, br. 337-00-3/2024-05/10: „Derivatives of phenolic compounds: experimental and theoretical investigation of their antioxidant effect and oxidation pathways"
  • Bilateralni projekat Srbija–Austrija 2024–2026, br. 337-00-216/2023-05/259: „Preventing LPMO from self-destruction by oxidative damage"
  • DAAD Project: Cooperative international Master study program Applied Chemistry – GeSeMAC (MSc)

Saradnja sa drugim naučnoistraživačkim institucijama

  • Prirodno-matematički fakultet Univerziteta u Kragujevcu
  • Institut za informacione tehnologije Univerziteta u Kragujevcu
  • Fakultet agrobiotehničkih nauka u Osijeku, Hrvatska
  • Institut Ruđer Bošković u Zagrebu, Hrvatska
  • Institut za nauku o hrani i ishrani, Fakultet za hemijsku i prehrambenu tehnologiju, Bratislava, Slovačka
  • Univerzitet primenjenih nauka u Merseburgu, Nemačka
  • Univerzitet u Hailu, Saudijska Arabija
  • Prirodno-matematički fakultet Univerziteta u Mariboru
  • Fakultet za hemiju i hemijsku tehnologiju Univerziteta u Mariboru
  • Departman za matematiku, Normalni univerzitet u Šiningu, Kina
  • Departman za matematiku, Šahid Madani univerzitet, Tabriz, Iran

Postignuti rezultati

Doktorske disertacije i master radovi:

Naučni radovi i saopštenja na naučnim skupovima

Rad Laboratorije za hemoinformatiku doprineo je publikovanju velikog broja rezultata u međunarodnim časopisima visoke citiranosti, zatim u časopisima od nacionalnog značaja, kao i predstavljanju rezultata na međunarodnim i nacionalnim naučnim skupovima. U nastavku su dati neki od odabranih rezultata rada Laboratorije publikovani u prethodne tri godine (za kompletan uvid u radove publikovane od strane članova Laboratorije koristiti linkove koji stoje uz imena istraživača Laboratorije):

  1. Simijonović D, Avdović E, Milić SJ, Antonijević M, Milenković D, Marković K, Grujović M, Stojković DL, Dekić M, Marković Z. Investigation of Antimicrobial and Anti-Inflammatory Efficacy of Newly Synthesized Pyrogallol-Coumarin Hybrids: In Vitro and In Silico Studies. Pharmaceutics. 2024;16(11):1472. DOI
  2. Jevtić M, Pirković MS, Komazec T, Mojić M, Mijatović S, Maksimović-Ivanić D, Dimić D, Marković Z, Simijonović D, Milenković D, Avdović E. A Comprehensive Evaluation of a Coumarin Derivative and Its Corresponding Palladium Complex as Potential Therapeutic Agents in the Treatment of Gynecological Cancers. Pharmaceutics. 2024;16(11):1437. DOI
  3. Milanović Ž, Marković Z, Kesić A, Jovanović Stević S, Petrović B, Avdović E. Influence of acid–base equilibrium on interactions of some monofunctional coumarin Pd(II) complexes with biologically relevant nucleophiles. Dalton Transactions. 2024;53(19):8275–8288. DOI
  4. Milanović Ž, Dimić D, Avdović EH, Simijonović DM, Nakarada Đ, Jakovljević V, Vojinović R, Marković ZS. Mechanism of Antiradical Activity of Coumarin-Trihydroxybenzohydrazide Derivatives: A Comprehensive Kinetic DFT Study. Antioxidants. 2024;13(2):143. DOI
  5. Gutman I, Furtula B, Redžepović I. On Topological Indices and Their Reciprocals. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;91:287–297. Link
  6. Gutman I, Redžepović I, Pantović S. Note on Some New (n, m)-Type Bounds for Graph Energy. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;91(3):797–803. Link
  7. Redžepović I, Soldatović TV. Comparative Cheminformatics Study on Structural and Physiological Similarity of Bridged Heterometallic Complexes. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;92(2):317–336. Link
  8. Akbar A, Gutman I, Furtula B, Redžepović I, Došlić T, Zahid R. Extremal Results and Bounds for Atom-Bond Sum-Connectivity Index. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;92(2):271–314. Link
  9. Akbar A, Gutman I, Redžepović I, Mazorodze JP, Albalahi AM, Amjad HE. On the Difference of Atom-Bond Sum-Connectivity and Atom-Bond-Connectivity Indices. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2024;91(3):725–740. Link
  10. Antonijević M, Avdović E, Simijonović D, Milanović Ž, Žižić M, Marković Z. Investigation of novel radical scavenging mechanisms in the alkaline environment: Green, sustainable and environmentally friendly antioxidative agent(s). Science of The Total Environment. 2024;912:169307. DOI
  11. Akbar A, Gutman I, Redžepović I, Albalahi AM, Raza Z, Hamza AE. Symmetric Division Deg Index: Extremal Results and Bounds. MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 2023;90(2):269–299. Link
  12. Marković Z, Komolkin AV, Egorov AV, Milenković D, Jeremić S. Alizarin as a potential protector of proteins against damage caused by hydroperoxyl radical. Chemico-Biological Interactions. 2023;373:110395. DOI
  13. Simijonović DM, Milenković DA, Avdović EH, Milanović ŽB, Antonijević MR, Amić AD, Dolićanin Z, Marković ZS. Coumarin N-Acylhydrazone Derivatives: Green Synthesis and Antioxidant Potential—Experimental and Theoretical Study. Antioxidants. 2023;12(10):1858. DOI
  14. Milanović Ž, Antonijević M, Avdović E, Simić V, Milošević M, Dolićanin Z, Kojić M, Marković Z. In silico evaluation of pharmacokinetic parameters, delivery, distribution and anticoagulative effects of new 4,7-dihydroxycoumarin derivative. J. Biomol. Struct. Dyn. 2023;42(16):8343–8358. DOI
  15. Milanović Ž, Dimić D, Klein E, Biela M, Lukeš V, Žižić M, Avdović E, Bešlo D, Vojinović R, Dimitrić Marković J, Marković Z. Degradation Mechanisms of 4,7-Dihydroxycoumarin Derivatives in Advanced Oxidation Processes: Experimental and Kinetic DFT Study. Int. J. Environ. Res. Public Health. 2023;20(3):2046. DOI

Monografije

Rad Laboratorije za hemoinformatiku rezultirao je i objavljivanjem sledećih monografija, tj. poglavlja u monografskim studijama:

  1. Svetlana Marković, Zoran Marković. Molekulsko modeliranje. Centar za naučno istraživački rad SANU i Univerziteta u Kragujevcu, 2012. ISBN 978-86-81037-32-4
  2. Jeremić S, Marković Z. Free Radical Scavenger Activity and P-glycoprotein Inhibition Capacity of 1,2,4-Trihydroxyxanthone. In: Filipovic N, editor. Computational Bioengineering and Bioinformatics. ICCB 2019. Learning and Analytics in Intelligent Systems, vol 11. Springer, Cham, 2020. DOI